只有到了近代，随着学问的专门化，“科学”才从“神学”中独立出来。从此以后，所谓“科学”，指的是可以观察和验证的学问；所谓“神学”，指的是科学之外的那些不可以通过观察进行验证的学问，更多地需要人们无条件地相信。
在利玛窦进京时，哥白尼和伽利略的理论正在形成，但笛卡尔出生没几年，牛顿还没有出生。因此，利玛窦时期的学问依然属于经院哲学体系下的自然哲学，或者说，更多的是从古希腊罗马和阿拉伯学来的，也就是说当时的科学、哲学、宗教是不分家的。由于西方的经院哲学体系的发展，最好的学问已经集中在传教士之中
只有到了近代，随着学问的专门化，“科学”才从“神学”中独立出来。从此以后，所谓“科学”，指的是可以观察和验证的学问；所谓“神学”，指的是科学之外的那些不可以通过观察进行验证的学问，更多地需要人们无条件地相信。
在利玛窦进京时，哥白尼和伽利略的理论正在形成，但笛卡尔出生没几年，牛顿还没有出生。因此，利玛窦时期的学问依然属于经院哲学体系下的自然哲学，或者说，更多的是从古希腊罗马和阿拉伯学来的，也就是说当时的科学、哲学、宗教是不分家的。由于西方的经院哲学体系的发展，最好的学问已经集中在传教士之中